Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms