Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAAF3Q8N9W5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms