Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q1

CYB561D1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561D1Q8N8Q1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYB561D1Q8N8Q1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms