Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms