Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8DQ7L1W4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8DQ7L1W4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8DQ7L1W4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8DQ7L1W4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8DQ7L1W4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8DQ7L1W4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8DQ7L1W4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8DQ7L1W4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8DQ7L1W4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8DQ7L1W4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8DQ7L1W4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8DQ7L1W4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms