Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC4Q6S5L8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms