Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDD2Q6NTF9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDD2Q6NTF9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDD2Q6NTF9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDD2Q6NTF9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDD2Q6NTF9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDD2Q6NTF9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDD2Q6NTF9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDD2Q6NTF9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDD2Q6NTF9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDD2Q6NTF9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDD2Q6NTF9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDD2Q6NTF9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms