Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms