Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF212Q495C1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms