Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP24-1Q3LI83 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP24-1Q3LI83 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms