Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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