Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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NRF1Q16656 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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NRF1Q16656 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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NRF1Q16656 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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NRF1Q16656 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRF1Q16656 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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NRF1Q16656 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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NRF1Q16656 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRF1Q16656 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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NRF1Q16656 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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NRF1Q16656 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRF1Q16656 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRF1Q16656 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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NRF1Q16656 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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