Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SS18Q15532 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SS18Q15532 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SS18Q15532 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SS18Q15532 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SS18Q15532 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SS18Q15532 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SS18Q15532 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SS18Q15532 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SS18Q15532 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SS18Q15532 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SS18Q15532 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SS18Q15532 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SS18Q15532 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SS18Q15532 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SS18Q15532 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SS18Q15532 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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