Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3CQ15386 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms