Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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RAB35Q15286 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RAB35Q15286 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RAB35Q15286 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RAB35Q15286 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RAB35Q15286 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB35Q15286 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB35Q15286 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB35Q15286 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB35Q15286 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB35Q15286 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB35Q15286 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB35Q15286 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB35Q15286 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB35Q15286 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB35Q15286 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB35Q15286 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB35Q15286 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB35Q15286 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB35Q15286 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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