Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSME4Q14997 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME4Q14997 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms