Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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