Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
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