Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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