Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN13Q12923 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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