Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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GTF3C1Q12789 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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GTF3C1Q12789 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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GTF3C1Q12789 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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GTF3C1Q12789 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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GTF3C1Q12789 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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