Protein–RNA interactions for Protein: Q08924

RTT10, Regulator of Ty1 transposition protein 10, yeastyeast

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT10Q08924 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.51□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 ZIP2YGL249W 2115 nt2.51□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 ENV11YGR071C 2583 nt2.51□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 NUM1YDR150W 8247 nt2.51□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 MAK10YEL053C 2202 nt2.5□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 RTT107YHR154W 3213 nt2.5□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 NAM7YMR080C 2916 nt2.5□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 YGL217CYGL217C 342 nt2.5□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 CDC60YPL160W 3273 nt2.5□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 RAD34YDR314C 2079 nt2.49□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 SLN1YIL147C 3663 nt2.49□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 SPO21YOL091W 1830 nt2.49□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.49□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 SYH1YPL105C 2550 nt2.49□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 PSD2YGR170W 3417 nt2.48□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 YRB1YDR002W 606 nt2.48□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 YJL120WYJL120W 324 nt2.48□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 ATP7YKL016C 525 nt2.48□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 RPS25BYLR333C 327 nt2.48□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 YBR174CYBR174C 315 nt2.48□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 CAT2YML042W 2013 nt2.47□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 SIR3YLR442C 2937 nt2.47□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.47□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 TIM9YEL020W-A 264 nt2.47□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 ECM12YHR021W-A 456 nt2.47□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.47□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 snR46snR46 197 nt2.47□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 ELG1YOR144C 2376 nt2.47□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 MSH5YDL154W 2706 nt2.47□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 YFR016CYFR016C 3702 nt2.46□□□□□ -2.01
RTT10Q08924 SEC26YDR238C 2922 nt2.46□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 APL2YKL135C 2181 nt2.46□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 MAD1YGL086W 2250 nt2.46□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 MRP10YDL045W-A 288 nt2.46□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 ULI1YFR026C 510 nt2.46□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 YOR170WYOR170W 306 nt2.46□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 RPL37BYDR500C 267 nt2.45□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 NOC3YLR002C 1992 nt2.45□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 CHC1YGL206C 4962 nt2.44□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 UBP1YDL122W 2430 nt2.44□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 SPF1YEL031W 3648 nt2.44□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 PET309YLR067C 2898 nt2.44□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 MLH3YPL164C 2148 nt2.44□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 TOR1YJR066W 7413 nt2.43□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.43□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 YPR097WYPR097W 3222 nt2.43□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 REV3YPL167C 4515 nt2.42□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 YIR044CYIR044C 186 nt2.42□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 RTT101YJL047C 2529 nt2.42□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 PDR1YGL013C 3207 nt2.41□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 CTR9YOL145C 3234 nt2.41□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 RPL31AYDL075W 342 nt2.41□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 VTC1YER072W 390 nt2.41□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 STE11YLR362W 2154 nt2.41□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 SSD1YDR293C 3753 nt2.4□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.4□□□□□ -2.02
RTT10Q08924 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.4□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 COF1YLL050C 432 nt2.4□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 TRA1YHR099W 11235 nt2.4□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 HMI1YOL095C 2121 nt2.39□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 PIG1YLR273C 1947 nt2.39□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 AGC1YPR021C 2709 nt2.39□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 snR52snR52 92 nt2.39□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 DGR2YKL121W 2559 nt2.39□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 SCP160YJL080C 3669 nt2.38□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 YLL007CYLL007C 1998 nt2.38□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 YNL170WYNL170W 396 nt2.38□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 TOF1YNL273W 3717 nt2.38□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 PHO91YNR013C 2685 nt2.38□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 IST2YBR086C 2841 nt2.37□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 BUD2YKL092C 3315 nt2.37□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 ARP8YOR141C 2646 nt2.37□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 NUP170YBL079W 4509 nt2.37□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 PDR11YIL013C 4236 nt2.37□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 IRE1YHR079C 3348 nt2.37□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 PTP2YOR208W 2253 nt2.37□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 LRE1YCL051W 1752 nt2.36□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 CUL3YGR003W 2235 nt2.36□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 VPS13YLL040C 9435 nt2.36□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 PAU3YCR104W 375 nt2.35□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 IRA2YOL081W 9240 nt2.35□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 APL5YPL195W 2799 nt2.34□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.34□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 YOR345CYOR345C 351 nt2.34□□□□□ -2.03
RTT10Q08924 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.33□□□□□ -2.04
RTT10Q08924 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.33□□□□□ -2.04
RTT10Q08924 CSF1YLR087C 8877 nt2.32□□□□□ -2.04
RTT10Q08924 TDA9YML081W 3756 nt2.32□□□□□ -2.04
RTT10Q08924 YDL196WYDL196W 330 nt2.32□□□□□ -2.04
RTT10Q08924 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.32□□□□□ -2.04
RTT10Q08924 HIR3YJR140C 4947 nt2.31□□□□□ -2.04
RTT10Q08924 NCA2YPR155C 1851 nt2.31□□□□□ -2.04
RTT10Q08924 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.31□□□□□ -2.04
RTT10Q08924 YOR055WYOR055W 435 nt2.31□□□□□ -2.04
RTT10Q08924 RPL33BYOR234C 324 nt2.31□□□□□ -2.04
RTT10Q08924 PIP2YOR363C 2991 nt2.31□□□□□ -2.04
RTT10Q08924 YOL098CYOL098C 3114 nt2.31□□□□□ -2.04
RTT10Q08924 SVL3YPL032C 2478 nt2.3□□□□□ -2.04
RTT10Q08924 YDL118WYDL118W 381 nt2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9 ms