Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBQ06643 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms