Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN1Q04323 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms