Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms