Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYBPC1Q00872 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms