Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2C1P98194 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms