Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms