Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP2P63027 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms