Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTEP56180 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTEP56180 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPTEP56180 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPTEP56180 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TPTEP56180 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPTEP56180 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPTEP56180 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPTEP56180 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPTEP56180 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPTEP56180 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPTEP56180 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TPTEP56180 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TPTEP56180 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPTEP56180 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPTEP56180 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms