Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX9P55771 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX9P55771 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX9P55771 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms