Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA1P49639 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms