Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms