Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB2P29033 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB2P29033 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB2P29033 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB2P29033 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB2P29033 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB2P29033 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB2P29033 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB2P29033 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB2P29033 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB2P29033 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB2P29033 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB2P29033 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB2P29033 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB2P29033 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB2P29033 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB2P29033 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB2P29033 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB2P29033 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB2P29033 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB2P29033 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB2P29033 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB2P29033 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB2P29033 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB2P29033 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB2P29033 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB2P29033 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB2P29033 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB2P29033 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB2P29033 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB2P29033 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB2P29033 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB2P29033 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB2P29033 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB2P29033 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB2P29033 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB2P29033 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB2P29033 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB2P29033 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB2P29033 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB2P29033 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB2P29033 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB2P29033 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB2P29033 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB2P29033 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB2P29033 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB2P29033 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB2P29033 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB2P29033 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB2P29033 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB2P29033 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms