Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCAP28676 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GCAP28676 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GCAP28676 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCAP28676 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCAP28676 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms