Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSP16219 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSP16219 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSP16219 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSP16219 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSP16219 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSP16219 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSP16219 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSP16219 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSP16219 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSP16219 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSP16219 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSP16219 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSP16219 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSP16219 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSP16219 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSP16219 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSP16219 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSP16219 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSP16219 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSP16219 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSP16219 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSP16219 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSP16219 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSP16219 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSP16219 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSP16219 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSP16219 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSP16219 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSP16219 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSP16219 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms