Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG2P13521 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG2P13521 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG2P13521 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCG2P13521 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCG2P13521 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCG2P13521 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCG2P13521 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCG2P13521 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG2P13521 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG2P13521 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG2P13521 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG2P13521 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG2P13521 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG2P13521 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG2P13521 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG2P13521 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms