Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYL1P12980 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LYL1P12980 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms