Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM1P0DP23 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms