Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms