Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA1P02647 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA1P02647 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA1P02647 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA1P02647 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA1P02647 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA1P02647 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA1P02647 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA1P02647 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA1P02647 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA1P02647 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA1P02647 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA1P02647 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA1P02647 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA1P02647 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOA1P02647 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA1P02647 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms