Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms