Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX15O60248 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX15O60248 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX15O60248 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms