Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP290O15078 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP290O15078 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP290O15078 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP290O15078 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP290O15078 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP290O15078 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP290O15078 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP290O15078 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP290O15078 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP290O15078 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP290O15078 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP290O15078 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP290O15078 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP290O15078 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP290O15078 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP290O15078 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP290O15078 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP290O15078 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP290O15078 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP290O15078 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP290O15078 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP290O15078 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP290O15078 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP290O15078 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP290O15078 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP290O15078 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP290O15078 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP290O15078 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP290O15078 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP290O15078 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP290O15078 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CEP290O15078 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP290O15078 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP290O15078 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP290O15078 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP290O15078 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CEP290O15078 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP290O15078 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP290O15078 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP290O15078 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP290O15078 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP290O15078 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP290O15078 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP290O15078 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP290O15078 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP290O15078 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP290O15078 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP290O15078 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP290O15078 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP290O15078 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CEP290O15078 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CEP290O15078 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CEP290O15078 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP290O15078 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP290O15078 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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