Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms