Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QRK9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QRK9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QRK9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QRK9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms