Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms