Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
E9PCH4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
E9PCH4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
E9PCH4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
E9PCH4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
E9PCH4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
E9PCH4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
E9PCH4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
E9PCH4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
E9PCH4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
E9PCH4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
E9PCH4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
E9PCH4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
E9PCH4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
E9PCH4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
E9PCH4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
E9PCH4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
E9PCH4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
E9PCH4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
E9PCH4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
E9PCH4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
E9PCH4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
E9PCH4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
E9PCH4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
E9PCH4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
E9PCH4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
E9PCH4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
E9PCH4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
E9PCH4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
E9PCH4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
E9PCH4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
E9PCH4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
E9PCH4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
E9PCH4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
E9PCH4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
E9PCH4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
E9PCH4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
E9PCH4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
E9PCH4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
E9PCH4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
E9PCH4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
E9PCH4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
E9PCH4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
E9PCH4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
E9PCH4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
E9PCH4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
E9PCH4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
E9PCH4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
E9PCH4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
E9PCH4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
E9PCH4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
E9PCH4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
E9PCH4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
E9PCH4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
E9PCH4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
E9PCH4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms