Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MVJ9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MVJ9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms