Protein–RNA interactions for Protein: A4D126

ISPD, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISPDA4D126 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ISPDA4D126 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ISPDA4D126 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms